Ti ricordiAlphaFold2, questo modello di intelligenza artificiale piuttosto folle di Google DeepMind che ha fatto grandi progressi nella previsione delle strutture proteiche? Ebbene, il versione 3 è appena arrivata e sta spingendo ancora oltre i limiti!
AlphaFold 3 è come passare da un film in bianco e nero come La Mucca e il Prigioniero a un film in 3D come Avatar, perché non solo prevede con una precisione impressionante il Struttura 3D delle proteinema è anche in grado di modellarli interazioni con tutta una serie di altre molecole: DNA, RNA, piccole molecole organiche come i farmaci e persino modifiche chimiche.
Concretamente ciò significa che potremo comprendere meglio come funzionano tutte queste molecole che ci compongono riunirsi e lavorare insieme, come gli ingranaggi dell’orologio cosmico dell’VIII secolo. Un grande passo avanti nella decifrazione del file processi biologici fondamentali e le loro disfunzioni all’origine delle malattie.
Il suo segreto, ovviamente, è a architettura della rete neurale ancora più potente e addestrato su una montagna di dati molecolari. Il cuore del sistema si basa su un modulo Evoformer migliorato, abbinato a un nuovo approccio basato su reti di trasmissione che partono da una nuvola di atomi per convergere verso la struttura molecolare più probabile.
E i risultati sono davvero impressionanti poiché sui set di dati di riferimento, AlphaFold 3 batte i record con miglioramenti significativi rispetto ai metodi esistenti. Per alcune categorie di interazioni, come quelle con i farmaci, esso aumenta addirittura significativamente la precisione predizioni. E tutto questo senza nemmeno aver bisogno di dati strutturali come input.
Ma la cosa più bella è che lo è fonte aperta e accessibile gratuitamente alla comunità scientifica tramite il nuovo server AlphaFold. Questo strumento consente a qualsiasi ricercatore di generare previsioni per le proteine di interesse in pochi clic, laddove prima richiedeva un’enorme quantità di lavoro e risorse significative. In breve, abbastanza per democratizzare la biologia strutturale e accelerare le scoperte!
Ovviamente, da un tale potere derivano anche grandi responsabilità, quindi le grandi menti dietro DeepMind hanno lavorato a lungo con numerosi esperti e organizzazioni per definire un quadro etico e limitare i rischi di uso improprio come si suol dire. Perché per quanto un AlphaFold nelle mani giuste possa far avanzare la scienza e la medicina in modo spettacolare, non vogliamo vedere arrivare virus o prioni killer progettati da apprendisti stregoni.
Ma non vedo l’ora di vedere cosa sarà in grado di fare la comunità scientifica con questo brillante strumento. Forse qualche novità enzimi per applicazioni industrialidelle materiali di ispirazione bio con proprietà uniche, o proteine terapeutiche più efficace? In ogni caso una cosa è certa, il rivoluzione biotecnologica è solo all’inizio e non c’è dubbio che AlphaFold 3 sarà uno dei protagonisti!
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