Il microbiota intestinale è un ecosistema di diverse centinaia di specie microbiche (batteri, lieviti, ecc.) che si forma gradualmente dopo la nascita negli animali e nell’uomo. Se la composizione del microbiota intestinale è specifica per ciascun individuo, recenti studi sull’uomo e sugli animali hanno dimostrato che la varietà del microbiota osservata all’interno di una popolazione può essere raggruppata in grandi categorie che presentano caratteristiche simili in termini di gruppi batterici rappresentati. Si ritiene spesso che l’ambiente, in particolare quello materno alla nascita, e la dieta siano i principali fattori che influenzano la composizione del microbiota nei giovani. D’altra parte, l’importanza dei fattori genetici dell’ospite sul suo microbiota è ancora dibattuta perché scarsamente valutata. Per la prima volta selezionata una squadra INRAE 2 linee di suini i cui genitori sono stati scelti in base a 2 tipi di microbiota intestinale. Gli scienziati hanno quindi studiato l’influenza dei fattori genetici sulla formazione del microbiota intestinale di 1.000 maiali nell’arco di 3 generazioni.
Linee di suini selezionati per il loro microbiota intestinale
Per valutare se sia possibile selezionare i suini in base alla composizione del loro microbiota intestinale, gli scienziati hanno innanzitutto dimostrato che è possibile dividere i suinetti di 60 giorni di età in 2 gruppi corrispondenti a 2 tipi di microbiota chiamati enterotipi. Ogni enterotipo è caratterizzato da una relativa sovrabbondanza di 2 generi batterici: Prevotella e Con Mitsuoke per l’enterotipo PM, e Ruminococco e Treponema per l’enterotipo RT. Per la creazione delle 2 linee selezionate, gli allevatori sono stati scelti sulla base di un’analisi delle feci, per trattenere quelli che presentavano un microbiota di tipo PM o RT. Quindi i suinetti delle 2 linee sono stati allevati esattamente nelle stesse condizioni (stesso posto, stesso cibo).
I risultati mostrano che nella linea selezionata per l’enterotipo PM, la frequenza di questo enterotipo è aumentata dal 53% nella popolazione iniziale prima della selezione all’87% dopo 3 generazioni; nell’altro ceppo, la frequenza dell’enterotipo RT è aumentata dal 47% al 70%. Le analisi della velocità di crescita delle 2 linee mostrano che i suini selezionati sul microbiota di tipo PM hanno una crescita più rapida fino a 70 giorni di età. Ulteriori analisi hanno rivelato che i 2 enterotipi contengono batteri con attività metaboliche diverse. L’enterotipo PM è notevolmente più ricco di geni batterici capaci di degradare l’amido, metabolizzare gli zuccheri e sintetizzare importanti aminoacidi. Grazie a queste 2 linee di suini, proseguirà il lavoro per studiare la stabilità degli enterotipi durante la vita degli animali e la loro influenza sulla produzione, salute e comportamento dei suini.
Questi risultati dimostrano che la genetica dell’animale ha un’influenza significativa sulla formazione del suo microbiota intestinale e che la sua composizione non dipende solo dall’ambiente. Confermano l’interesse di tenere conto del microbiota intestinale negli schemi di selezione per migliorare la sostenibilità e la resilienza nell’allevamento.
